農業法人 M&A・事業承継
中小農業法人経営者・認定農業者の
後継者難倒産が、
過去最多水準。
農業（農業法人）（農業法人・農産業・農場経営）の事業承継・M&A・事業承継対策に特化。
農地法対応・補助金承継・取引先・農機/設備引継ぎまで、実務目線で設計します。
※ 中小企業の後継者不在率は約 50.1%（帝国データバンク2024年調査）。うち 農業法人領域でも、後継者不在を理由とする廃業・倒産が増加傾向。人件費高騰と需要構造変化が、廃業判断を加速させています。
長年積み上げた農業法人の技術と、
従業員と、顧客の信頼を、
畳まずに渡す方法があります。
一人で抱え込む必要はありません。
農地を守り、担い手を守り、
従業員を守り、経営者の次の人生を設計する。
農地法・農地所有適格法人要件・
認定農業者制度・農地中間管理機構（農地バンク）。
農業委員会・JA・行政との事前調整と
買い手との交渉を一体で設計し、
承継後の混乱を未然に防ぎます。
いま、農業法人・
農業経営体に
起きていること
DATA & CONTEXT
農業経営体は全国 92万9千経営体（令和5年、農林水産省 農業構造動態調査）、うち団体経営体は 4万1千（前年比1.5%増）と法人化が進行しています。認定農業者は 21万6,784経営体（令和6年3月）、うち法人は 2万9,128です。一方で個人経営体は5年前比 23.9%減と急減しており、団体・法人への集約が加速しています。
基幹的農業従事者は 111万4千人（令和6年）と20年で半減しました。平均年齢は 69.2歳、65歳以上が71.7%を占めます（農林水産省 食料・農業・農村白書 令和6年版）。引退時期の判断が一斉に重なる「農業版2025年問題」の渦中にあり、地域の担い手不足は日々深刻化しています。
個人経営体は 78万9千経営体（5年前比23.9%減、農林水産省 2020年農林業センサス）。後継者を確保できているのは 約28%にとどまり、後継者不在率は約72%に達しています。離農の選択肢として、農地バンクへの貸付・第三者承継・農業法人化が現実的な出口となりつつあります。
承継スキームの
3類型と特徴
SCHEME COMPARISON
経営の法人形態と農地の権利関係によって、選択できる承継スキームが大きく異なります。個人の農業経営では「事業譲渡＋農地法3条許可」が原則となり、農地ごとに農業委員会の許可が必要となる点が最大の論点です。早い段階で形態を整理しておくことが、選択肢の幅を広げます。
| 経営の形態 | M&Aスキーム | 特徴 |
|---|---|---|
| 個人の農業経営 （最も多い形態） |
事業譲渡 （一択） |
農機・施設・農地賃貸借契約・販路を個別承継。農地は3条許可で個別に権利移転、認定農業者資格は新規取得が必要。 |
| 農地所有適格法人 （株式会社・農事組合法人） |
株式譲渡 （または持分譲渡） |
法人格ごと継承で、農地・農機・JA関係・補助金適格性・認定農業者資格をセットで引継ぎ。承継後も農地所有適格法人要件（議決権・役員要件）の維持が必要。 |
| 農地貸借型 （農地中間管理機構活用） |
農地集積バンクへの貸付 | 農地中間管理機構へ貸付→担い手農業者・農業法人へ転貸。賃料収入を得つつ、段階的離農が可能。 |
行政手続きの実務
「農地法3条許可」を
どう取りに行くか
REGULATORY PRACTICE
農業法人・農業経営M&Aの最大の論点は、農業委員会による農地法3条許可と、認定農業者・補助金資格の引継ぎです。個人事業の譲渡では、農地は 「個別の権利移転＋3条許可」 となります。営農の継続を確保するため、農業委員会・JA・行政との事前調整を綿密に行うことが、承継成否を分けます。
（農業経営基盤強化促進法）
（租税特別措置法第61条の2）
承継時に注意すべきは、認定農業者資格を失効すると、準備金残高が翌年度に全額収入算入される点です。事業譲渡で認定が一時的に切れる場合、税負担が一時的に発生する可能性があるため、承継スケジュールと税務処理を一体で設計する必要があります。
（スーパーL資金・農業近代化資金等）
承継者が認定農業者を新規取得し、スーパーL資金の継続適用を受けられる設計とすることで、資金繰り面の連続性を確保します。当社では公庫・JAとの事前協議をスキーム策定段階から組み込みます。
地域計画（人・農地プラン）の全市町村義務化により、農地集約の流れは更に加速しており、農業委員会・農地バンク・JA・市町村との連携設計が承継の質を左右します。
雇用条件（給与・勤務時間・勤続年数の通算・退職金引継・有給休暇引継）について、買い手と事前に擦り合わせ、可能な限り 現在と同等以上の条件で継続雇用される設計を最優先で交渉します。雇用就農の研修生がいる場合、承継後の研修継続・キャリアパスについても整理が必要です。
「廃業」と「承継」の
収支比較
CLOSURE vs SUCCESSION
引退を考え始めた経営者の方から最初によく頂くご質問は「そもそもうちの農業経営に値段がつくのか」というものです。比較すべきは、第三者承継の対価ではなく、廃業した場合のコストです。廃業は「ゼロ」ではなく、通常はマイナスから始まる選択肢になります。
状態良好なら買取で相殺の可能性
承継対価に含まれる可能性
繰上返済手数料・保証人解除手続き
(保証人変更・公庫協議が必要)
準備金の継続適用が可能
長期勤務者がいると相応の負担
退職金支出は発生しない(または承継)
になる場合があります
可能性があります
※上記は典型的な傾向の整理であり、個別事例の数値は地域・品目・経営面積・収益性・農地の権利関係・従業員構成等により大きく変動します。当社では、初期相談時に 廃業シナリオと承継シナリオの収支比較を整理し、判断材料をご提供します。最終的な税務処理の確定は、顧問税理士・公認会計士にご確認ください。
多くの経営者の方が「自分の農業経営は規模も大きくないし、価値はつかないだろう」とおっしゃいます。しかし、新規就農を志望する若手農業者・多角化を進める農業法人グループにとっては、地域に根差した既存の農地・販路、稼働中の農機・施設、訓練された従業員は、新規就農の初期投資（一般に数千万円規模）と比べて極めて魅力的な選択肢です。地域に対して受け手が確実にいるか、まずは無料相談で確かめていただくことをお勧めします。
代表からのメッセージ
MESSAGE
成約事例
CASE STUDIES
60代、ハウス10棟、年商9,000万円。
そのまま残せた。」
段階的離農を希望、年商1.2億円。
地域に農地を残せた。」
水田作（米・麦）／畑作（野菜・果樹）／
施設園芸（トマト・きゅうり・いちご）／
畜産（酪農・肉用牛・養豚・養鶏）／
花卉・花木／茶業／
農業法人（株式会社・農事組合法人）／
集落営農・生産組合
※各事例の譲渡対価・スキームは概算・参考値です。弊社の成約実績および
業界の平均的な成約条件を参考にしており、実際の対価は
BS/PL（貸借対照表・損益計算書）、
品目・経営面積・農地の権利関係・
農機の状態など、
個別要因により変動します。
渡し方を設計する、
4つの柱
FOUR PILLARS
弐
認定農業者・補助金の
継承を設計する
認定農業者の新規取得・経営改善計画の継承、農業経営基盤強化準備金の引継ぎ、経営所得安定対策・経営継承・発展等支援事業の活用まで、補助金・税務特例の連続性を確保します。
参
後継者マッチングと
JA・地域調整
新規就農志望の若手農業者、多角化を進める農業法人グループとのマッチング、JA・地域・市町村への開示と調整を、買い手と事前に擦り合わせ、承継後の地域での営農継続を確保します。
「自分の会社ならいくら？」「うちの段階で何ができる？」が気になる方は、お気軽にどうぞ。
まず企業価値をセルフ試算する →
直近の業界動向
RECENT TRENDS
農業経営基盤強化促進法の改正により、地域計画（人・農地プラン）の策定が全市町村で義務化されました。10年後の農地利用の姿を地図で示す「目標地図」の作成を通じて、担い手への農地集積が加速しています。単独経営での独立継続の難度が上がり、地域の担い手・農業法人との連携や承継を検討する場面が増えています。
団体経営体は 4万1千（令和5年・前年比1.5%増）、農業法人グループ・食品企業・ヘルスケアファンド系の買い手が、個人経営を承継して多角化する動きが拡大しています。農地所有適格法人要件により買い手は農業者を主体とする法人に限られるため、受け手の選択肢は、新規就農志望の若手農業者、地域の農業法人、グループ系農業法人と多様化しています。
まずは、お問い合わせを
売るか、売らないか。
迷っている段階でも、構いません。
秘密厳守・無料でお受けします。
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〒103-0013 東京都中央区日本橋人形町1-1-8 神山ビル3A
TEL: 03-4500-7730 ／ info@jfsc.jp
対応時間：平日 9:00〜18:00
※時間外・土日祝はお問い合わせフォームから24時間受付
M&Aをもっと知りたい方へ
内容は2026年4月時点の情報・公表統計に基づきます。
事業承継・労務・税務の個別具体的なご判断は、必ず税理士・弁護士・社会保険労務士等の専門家にご確認ください。
ページ表示・リンク等の不具合がございましたら、お問い合わせフォームよりご連絡ください。
公的データ・統計（出典明示）
農業 の代表的な敗訴・賠償判例（DD・PMI で重要）
M&A 後の簿外債務リスクを定量化するため、業種特有の敗訴判例・賠償実例を一次ソースで参照します。
※ 個別案件によって賠償額・責任範囲は大きく異なります。M&A 検討時の DD 段階で、貴社固有のリスクを弊社（日本財務戦略センター）と専門家（弁護士・税理士等）でご確認ください。
都道府県・主要都市別 農業M&A ガイド
JFSC は全国対応。各エリアの市場特性・許認可手続き・地元金融機関ネットワークに対応した 農業M&A 事業承継支援を行っています。
都道府県別
主要政令指定都市別
農業 に近い業種の M&A ガイド
同じ業界の隣接領域や、買い手候補としてシナジーが見込める業種の M&A 解説です。
広域エリア別 M&A・事業承継 動向
地方経済産業局・地方厚生局の管轄ごとの M&A 動向・支援機関情報をまとめています。
農業 の最新法改正・公的トピック（2024-2026年）
M&A 検討時の DD で把握すべき業種関連法の最新動向です。一次ソースから確認できます。
農業M&Aの注意点
農業のM&A・事業承継には、許認可承継・専門資格者の確保・運営基準充足・契約上の地位移転など、業種固有の注意点があります。実務上もっとも問題になりやすいポイントを整理しました。
-
1
農地所有適格法人の法的要件維持
農業生産法人がM&A後も農地を所有し続けるには、農地所有適格法人要件（①売上過半が農業、②農業関係者が議決権過半、③役員過半が農業従事、④特定農畜産物以外との兼営がない）を満たし続ける必要があります。買い手企業が非農業事業を主体とする場合、農地売却・賃貸化を強制される可能性があります。
-
2
農地法4条5条の承継と所有権移転手続き
M&A時に農地所有権が移転する場合、農地法5条の許可申請が必須です。買い手が農地所有適格法人でない場合、農地転用許可を得て非農地化するか、農業法人傘下に置く迂回手段が必要となり、手続期間（通常3〜6ヶ月）を考慮してください。
-
3
耕作放棄地・遊休農地の管理責任
売り手企業が保有する農地のうち、遊休状態の農地は農地中間管理機構に貸付けるか、買い手が引き継いで耕作義務を負う必要があります。放置農地は市町村から改善勧告を受け、最終的に強制買収される可能性があります。
-
4
農業委員会への事業報告義務
農地所有適格法人は毎事業年度終了後3ヶ月以内に農業委員会へ事業状況報告義務があります。買い手企業が報告要件を満たさない場合、農業委員会から適格性喪失勧告を受け、農地所有権を失う可能性があります。
-
5
水利権・共有地の管理と隣接関係
農地はしばしば水利組合の管理下にあり、M&A時に新しい経営主体への名義変更・負担金支払い義務が生じます。また隣接農地での紛争（肥料流入、薬剤飛散等）リスクを事前に把握し、買い手企業の農業経営能力を評価してください。
-
6
農業補助金・交付金の受給継続可能性
農業法人が経営所得安定対策・農地集約化補助金等を受給している場合、M&A後の補助対象要件を満たし続ける必要があります。買い手企業が非農業主体の場合、補助金返納・優遇税制の喪失を招く可能性があります。
※上記は農業M&Aで実務上問題になりやすい論点を整理したものです。個別案件では他にも検討すべき事項がございます。一次相談は無料でお受けしておりますのでお気軽にご相談ください。
数字で見る 農業法人業界の現在地
INDUSTRY STATISTICS
- 農業法人数（全国）：3.3万法人（2024） [農林水産省・令和6年農業構造動態調査]
- 認定農業者数：21.9896万経営体（2023） [農林水産省・認定農業者の認定状況]
- 農地の後継者不在率：32.8%（2025） [日本経済新聞・農水省調査]
- 5年以内後継者確保なし率：約70%（2024） [全国農業会議所・新規就農相談センター]
- 農業総産出額（全国）：9.4991兆円（2023） [JAcom農業協同組合新聞・農水省発表]
- 農業総産出額（2024年）：10兆円超（28年ぶり）（2024） [JAcom農業協同組合新聞]
- 6次産業化認定事業者数（累計）：約2,600件（2021） [農林水産省・6次産業化・地産地消法認定]
農業法人 M&A に効いてくる法令の地図
LEGAL FRAMEWORK
- 農地法（昭和27年法律第229号）：農地の売買・賃貸・転用を規制し、農地所有適格法人の要件を定める根本法。農地法3条は権利移転時の農業委員会許可、4条は転用許可、5条は権利移転＋転用の許可を定める。… [e-Gov法令検索・農地法]
- 農業経営基盤強化促進法（昭和55年法律第65号）：農地の流動化・集積を促進し、農業経営の基盤強化を目的とした法律。農業法人の設立要件・農地所有適格法人の子会社化を定める。… [e-Gov法令検索・農業経営基盤強化促進法]
- 経営承継円滑化法（平成20年法律第33号）：事業承継時の相続税・贈与税の納税猶予・免除制度を定める。農業法人については特例措置により100%の納税猶予が可能。… [国税庁・法人版事業承継税制パンフレット]
- 相続税納税猶予制度（農地等）：農業相続人が農地等を相続した場合、相続税支払いを猶予する制度。要件を満たすと全額免除も可能。… [国税庁タックスアンサー・No.4147]
- 食料・農業・農村基本法（平成11年法律第107号）：農業政策の基本目標・手段を定める基本法。農業の持続的発展と農村の多面的機能を定義。… [農林水産省・食料農業農村基本法]
- 六次産業化・地産地消法（平成23年法律第32号）：農林漁業者等による加工・販売の一体化事業を促進。総合化事業計画の認定制度で国の支援対象化。… [農林水産省・6次産業化・地産地消法]
判例・賠償事例で見る リスクの輪郭
JUDGMENTS & LIABILITIES
- 農地売買紛争：農地法3条許可を得ずに行った農地売買の効力について裁判例あり。無許可行為は原則無効。…／論点：農地法3条の許可要件と無許可売買の法律効果 [農林水産省・農地転用許可制度]
- 農業協同組合の不正競争：公正取引委員会が農業協同組合による不当な取引慣行の改善勧告を行った事例あり。主に独占禁止法上の不公正な取引方法が問題。…／論点：独占禁止法における農業協同組合の規制 [公正取引委員会・農業協同組合の活動に関する独占禁止法上の指針]
- 農地賃貸借紛争：農地の賃貸借契約の更新拒否、解除権行使についての裁判例が蓄積。農業委員会の仲介機能が重要。…／論点：農地法18条の賃貸借契約保護と更新拒否事由 [全国農業会議所]
業界団体と連携先のマップ
INDUSTRY ASSOCIATIONS
- 全国農業会議所（NCA（National Council of Agricultural Committees））：農業経営の安定・発展、担い手育成、農地流動化、紛争解決の支援 [公式]
- 公益社団法人日本農業法人協会（AJFA（Agricultural Corporations Association of Japan））：農業生産法人の経営確立・発展、調査研究、提案・提言、情報提供 [公式]
- 全国農業共済組合連合会（NOSAI全国連）（NOSAI（National Federation of Agricultural Mutual Aid Associations））：農業共済・収入保険制度の運営、農業リスク管理 [公式]
- JA全中（全国農業協同組合中央会）（JA Central Union）：農協ネットワークの統合、農産物販売支援、金融サービス [公式]
- 日本食農連携機構（JFACO）：農業法人のM&A支援、経営指導、業界情報提供 [公式]
保険の選び方と引継ぎ論点
INSURANCE
- 農業共済（農作物共済）：米・麦・大豆等の農作物を対象に、自然災害による減収・減質を補償。被害農家の経営安定に貢献。 [全国農業共済組合連合会（NOSAI全国連）]
- 畜産共済：牛・豚・鶏等の家畜を対象に、疾病・事故による損失を補償。畜産経営の安定化に寄与。 [NOSAI農業共済]
- 農業経営収入保険（収入保険）：全農作物を対象に、自然災害、価格低下、出荷解除等による収入減少を補償。農作物共済より広範な保険。 [NOSAI全国連・収入保険]
- 施設園芸共済：ハウス・施設を対象に、災害による建物・設備の損失を補償。高付加価値農業の保護。 [NOSAI兵庫]
承継スキームと税務の見取り図
M&A SCHEMES & TAX
- 株式譲渡（個人オーナーの場合）：所得税15% + 住民税5% + 復興特別所得税0.315% = 合計20.315%の分離課税。譲渡益から土地建物等の簿価を控除した利得に対して一律課税。… [M&Aキャピタルパートナーズ]
- 事業譲渡：事業譲渡益は譲渡法人の売上高として法人税課税対象。実効税率約34%（法人税23.2% + 地方譲渡税約10.8%）。消費税も加算される。… [fundbook・事業譲渡解説]
- 経営承継円滑化法（法人版事業承継税制）：相続税・贈与税の支払い猶予。農業法人は100%猶予対象。5年以上継続経営で納税免除。… [国税庁・法人版事業承継税制パンフレット]
- 農地等納税猶予制度：農業相続人が農地等を相続した場合、相続税支払いを猶予。全額免除可能な農地等がある場合は免除適用。… [農林水産省・農地相続税納税猶予]
農業法人 M&A・事業承継 ― 実務でよくあるご質問
農業法人の M&A 検討段階で特に質問が多い実務論点を、業界規制・一次ソース根拠に基づいて整理しました。
Q1. 農業法人のM&A相場はどのくらいか？
農業法人の売却相場は案件ごとに大きく異なるが、複数事例から数百万円～数億円規模が報告されている。
例：SAKEホールディングスの事例では300万円での買収。一般的には EBITDA 倍率 4-6倍が参考値。農地規模、畜産規模、6次産業化の有無で大きく変動。
出典：バトンズ・農業の売却案件一覧
Q2. 農地の譲渡に農業委員会の許可は必須か？
はい。
農地法第3条に基づき、農地の売買・賃借による権利移転には農業委員会の許可が必須。無許可で行った行為は無効となる。M&A時には農地の移転が発生するため、事前に農業委員会に相談し許可取得が必須。
出典：農林水産省・農地転用許可制度
Q3. M&A後、相続税納税猶予制度の継続は可能か？
可能。
M&A後、新オーナーが農業経営を継続し、経営承継円滑化法の要件を満たしていれば納税猶予が継続される。ただし、農地を転用したり非農業に転換すると猶予適用終了＆納税義務発生する。重要：後継者の農業経営の継続が前提条件。
出典：国税庁・相続税納税猶予制度
Q4. JA（農協）との取引関係はM&Aに影響するか？
影響する可能性がある。
多くの農業法人はJAから農業資金の融資、農産物の販売支援を受けている。M&A後、新オーナーが経営方針を変更する場合、JA との既存契約（農産物販売契約、信用供与契約）の引継・変更が課題となる。事前に JAとの協議が重要。
出典：公正取引委員会・農業協同組合ガイドライン
Q5. 認定農業者資格はM&A時に引き継がれるか？
いいえ。
認定農業者は個人単位の認定のため、法人への M&A 後は引き継がれない。新オーナーが認定農業者等の要件を満たさない場合、新規認定申請が必要となる。農業委員会での認定に 1-3か月要するため、事前対応が重要。
出典：農林水産省・認定農業者制度
Q6. 農業法人M&Aの際、従業員（農作業員）の継続雇用は義務か？
法律上の絶対義務ではないが、事業承継の実務上は重要。
雇用契約の引継に関して、労働契約法32条により使用者の変更に伴う同意ルールがある。農業法人の農作業員は高齢化傾向で貴重な人材のため、雇用継続しないと事業継続が困難になる場合が多い。契約上明確化が重要。
出典：日本M&Aセンター・農林水産業界M&Aガイド
Q7. 6次産業化事業の認定はM&A時に引き継がれるか？
いいえ。
6次産業化認定は個別事業者単位のため、経営主体が変わると新規認定申請が必要。ただし、M&A後も既存の総合化事業計画を継続実行する場合、農水省への変更届で対応可能な場合もある。事前に農水省との協議が重要。
出典：農林水産省・6次産業化認定制度
Q8. 農業法人が受けている補助金・助成金はM&A後も継続されるか？
補助金の種類によって異なる。
経営承継円滑化法の支援（納税猶予）は継続されるが、農水省の施設整備補助金（規模拡大型等）は受給条件を確認する必要がある。多くの補助金は「受給対象者の経営継続」が条件のため、M&A後に事業内容が変わる場合は返納義務が発生する可能性あり。
出典：農林水産省・農業の経営継承に関する手引き
Q9. M&A契約で農業法人特有の表明保証項目は何か？
①農地法3条許可の取得状況 ②農地所有適格法人要件の充足 ③相続税納税猶予制度の利用状況 ④6次産業化認定の有無と継続可能性 ⑤農業共済・収入保険の加入状況 ⑥JAとの契約内容 ⑦認定農業者の認定状況 ⑧農地の権利関係の明確性が重要。
特に農地の抵当権・譲渡担保が隠れていないか確認が必須。
出典：農業法人向け法律事務所・M&A解説
Q10. 競業避止条項は農業法人M&Aで有効か？
有効。
但し競業避止義務は個人の職業選択の自由（憲法22条）に抵触するため、期間・地域・業務内容を合理的範囲に限定する必要がある。農業の場合、通常 3-5年程度・売却地域内が目安。根拠のない過度な競業避止条項は無効となる可能性あり。
出典：M&A Story・農業関連解説